基因编辑

CRISPR是继RNA干扰技术、高通量测序技术等之后生物科学发展历史上最具颠覆性技术之一,使用高效、迅速且简单,在生物医学研究领域及临床实践中引起一场巨变。经过近几年的发展,CRISPR不仅成为了生物医学研究实验室的常规研究技术,也已经成功用于临床治疗和诊断,例如近期发表的启动于2016年的全世界第一个CRISPR基因编辑T细胞治疗肿瘤的临床实验证明安全可靠;此外,基于CRISPR的快速诊断技术在最近爆发的冠状病毒流感快速检测中大放异彩。CRISPR技术正被越来越多的研究人员用来改造人类基因以消除疾病,创造生命力更加顽强的植物,消灭病原体等。在过去的7年中CRISPR技术斩获了生命科学领域各种重量级奖项,包括生命科学突破奖,盖尔德纳国际奖等,《Science》年度突破、《Nature》年度人物均授予了CRISPR单碱基基因编辑技术的突破,2019年9月,北京大学邓宏魁组完成世界首例基因编辑治疗艾滋病和白血病,使CRISPR技术再一次成为生命科学的焦点。

CRISPR技术不仅能够在不同物种中对特定的基因进行敲除,敲入等,经过改造后还能在转录水平调控基因的表达或者沉默、对特定的基因进行原位标记、在细胞水平或体内对单碱基进行编辑(BE2,BE3,ABE等)、体外系统中用于病原微生物或者基因突变的检测等(Sherlock、DETECTR);此外,通过与慢病毒或AAV技术联合可以轻松在全基因组水平进行基因快速筛选,David Liu研究小组与2019年实现了无模板的基因敲入技术。

随着研究的深入,CRISPR/Cas9系统的应用更加便捷、高效,也更广泛,目前该技术成功应用于人类细胞、斑马鱼、小鼠以及细菌等基因组精确修饰,成为科研人员的强大工具,基于CRISPR临床实验已经取得初步成功。

培训内容
培训报到
理论讲解: 一、基因编辑技术简介(三代基因编辑工具) 1. ZFN 2.TALEN 3.CRISPR 二、CRISPR/Cas9基因编辑技术原理 1. CRISPR/Cas9发现历史 2. CRISPR/Cas9作用机制解析 3. CRISPR/Cas9系统改造策略
理论讲解: 一、sgRNA在线设计构建实战演练(1.靶基因序列查找2.sgRNA在线设计合成) 二、CRISPR/Cas9转染策略: 1.生物转染(慢病毒、腺相关病毒等) 2.物理转染 (电转核酸/RNP、显微注射、基因枪) 3.化学转染 (脂质体、阳离子聚合物) 三、CRISPR/Cas9 sgRNA效率检测,脱靶检测及解决策略 1、高保真Cas9(espCas9、Hifi-Cas9、Cluster1-Cas9)
理论讲解: 一、CRISPR技术应用解析 1.基因敲除(单基因敲除、多基因敲除、大片段删除、多靶点sgRNA载体构建策略) 2.基因敲入实战演练(gRNA选择、同源臂设计、导入,长片段导入策略/提高基因敲入效率策略,PITCh、HITI、CRISPR-转座酶高效基因敲入系统) 3.CRISPR在转录调控中的应用(转录激活、转录抑制系统) 4.CRISPR靶基因标记定位 二、CRISPR案例解析 1.基因敲除在小鼠模型构建、植物、细胞、细菌、真菌等中的应用案例解析 2.基于CRISPR的全基因组基因敲除高通量筛选策略(文库构建,选择,流程优化等) 3.基于CRISPR的全基因组转录激活/抑制高通量筛选策略(文库构建,选择,流程优化等) 三、CRISPR/Cas9与基因沉默技术(siRNA、shRNA)系统比较。
理论讲解: 一、单碱基基因编辑技术简介及在基因治疗中的应用 1.HF2-BE2 2.BE3系统 3.ABE系统4.单碱基基因编辑脱靶克服。 二、基因CRISPR的基因检测系统 1、CRISPR-Cas12a系统介绍(DETECTR) 2、CRISPR-Cas13a系统介绍(SHERLOCK-多重病原菌检测) 三、CRISPR/Cas9系统在肿瘤和遗传病治疗中应用解析 1、CRISPR结合免疫检查点抑制剂治疗肿瘤 2、单基因遗传病治疗(DMD、先天性黑朦、地中海贫血等) 3、CRISPR治疗HIV-基因编辑婴儿解析 4、CRISPR治疗HIV炎性白血病病例解析 四、新一代无模板基因敲入系统解析 1、CRISPR Primer-editing 基因敲入原理及应用
实验内容 培训内容
sgRNA敲除载体构建 1.靶基因序列查找
2.sgRNA在线设计合成
3.敲除载体选择及线性化
4. sgRNA连接,转化等
敲除载体转染及初步鉴定 1.敲除质粒转染
2.转染筛选及敲除效果鉴定
3.单克隆鉴定

参加对象

从事医学、生命科学、农学等领域科研工作者和高校教师及研究生。

授课方式

理论讲授和实际演练紧密结合。

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