能探知90%基因编辑领域的新CRISPR工具诞生| CRISPR周报

媲美CRISPR-Cas9 新CRISPR 工具探知90%的基因编辑领域

能探知90%基因编辑领域的新CRISPR工具诞生| CRISPR周报
代表通用dCas9系统(顶部)和Cascade系统(底部)的组件的插图:Gersbach Lab

2类CRISPR–Cas系统,例如Cas9和Cas12,已被广泛用于靶向真核基因组中的DNA序列。但是,代表自然界中所有CRISPR系统90%的1类CRISPR-Cas系统在基因组工程应用中仍未开发。

杜克大学的生物医学工程师利用此前未被探索的CRISPR技术,精确地调控和编辑人类细胞中的基因组。通过这种新方法,研究人员希望能极大地扩展基于CRISPR的生物医学工程师可用工具,为基因组工程技术开辟一个新的、多样化的前沿。

该项研究发表在9月23日的《Nature Biotechnology》杂志上。杜克大学鲁尼家族生物医学工程副教授Charles Gersbach和格斯巴赫实验室的博士后研究员Adrian Oliver是该项研究的领导者。

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目前,该团队对他们的研究以及该领域其他研究人员的研究感到乐观,此举也将激发科研人员对1类CRISPR系统的新研究。

Gersbach说:“该项目的目的是探索CRISPR系统的多样性。在过去的十年中,已经有成千上万篇关于CRISPR-Cas9的论文,但是我们一直在不断学习有关它的新知识。通过这项研究,我们将这种思维方式应用到了其中的另外90%。

来源:生物探索

香蕉要灭绝?!CRISPR或成为拯救香蕉的唯一希望

澳大利亚昆士兰科技大学的生物技术专家 James Dale 的团队,一直致力于通过从野生香蕉中选取抗病基因,对卡文迪什香蕉进行基因改造,该基因赋予了对黄叶病热带第4型抗性。

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James Dale 的团队正在使用CRISPR基因编辑技术来改造卡文迪什香蕉的的基因组,以增强其对黄叶病热带第4型的抵抗力。

具体来说,他们尝试打开卡文迪什香蕉的一个休眠基因,该基因赋予香蕉对黄叶病热带第4型。

这种方法不需要引入外源基因,因此可能更容易通过监管部门的批准。但是这项工作仍处于初期阶段,要等到几年才能进入试验阶段。

瑞典农业科学大学植物遗传学家 Rodomiro Ortiz,支持研究人员正在进行的针对卡文迪什香蕉的基因编辑,但他告诫不要只专注于对卡文迪什香蕉的改良。 

除了卡文迪什香蕉以外,地球上还有一千多种其他类型的香蕉。虽然它们有的不及卡文迪什香蕉的产量,有的无法运输,有的味道不好。

但是,它们是一个巨大的香蕉宝库,商业香蕉公司可以尝试改良这些品种来建立替代品种,这样也能让人们吃到多种多样的香蕉。

来源:BioWorld

CRISPR的开创者之一,现在又拿到了巨额融资

奥赛金牌、保送北大、哈佛读博,成为CRISPR基因编辑开创者之一,连发三篇Science 论文,入选福布斯2014年30岁以下30个科学医疗领域领军人物,入选2017年度“全球青年领袖”榜单,这样的人生简直开挂。

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2017年,杨璐菡和George Church教授共同创立了杭州启函生物科技有限公司。致力于使用基因编辑技术生产出可用于人体移植的安全有效的细胞、组织和器官,解决中国和世界器官移植供体严重短缺的问题。

2019年9月23日,杭州启函生物科技有限公司宣布完成2550万美元A+轮融资。启函生物于2018年7月获得A轮融资,至此完成A轮总融资金额合计3300万美元。

来源:BioWorld

那篇基因编辑CCR5的论文被质疑了

2019年6月4日,Nature Medicine杂志发表了来自来自加州大学伯克利分校的Xinzhu Wei和Rasmus Nielsen的一篇文章CCR5-Δ32 is deleterious in the homozygous state in humans,通过分析409693位英裔个体的基因型和死亡登记信息,发现CCR5-Δ32纯合个体的全因死亡率增加21%。

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文章中指出了这409693个样本来自于UK Biobank。

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9月14日,作者们在bioRxiv上发表的一篇文章Deviations from Hardy Weinberg Equilibrium at CCR5-Δ32 in Large Sequencing Data Sets。

该文章利用Genome Aggregation Database和NM一文中US Biobank的数据对文中所采用的Hardy Weinberg Equilibrium分析进行了重新审视,得到了数据可靠并无问题的结论。

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9月28日凌晨,文章的通讯作者Nielsen教授在Twitter上推文,指出这批数据背后的UK Biobank出现了错误。

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同时,本文的一作Xinzhu Wei也在Twitter上发了推文。

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来源:BioArtReports

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